Eur J Endocrinol:石蜡标本转录组分析在肾上腺皮质癌诊断和临床表现中的价值

2022-05-10 09:28 来源:北海男科医院

取材:人体内皮质肝癌(ACC)是一种常见的内表皮肝癌(每年每百万人里面有1-2实有),总体结节得病较差。诊疗对患儿管理制度至关重要,但由于这种疾得病的常见,诊疗很吃力。事实上,在人体内皮质(ACT)里面,ACC是常见的,大多数是人体内皮质腺瘤(ACA)。生理恶特质平均分称为Weiss平均分,最常可用诊疗。然而,具有里面等平均分和常见组成员织学性状的不非常容易被定义。特别是,确定由大细胞会和喜强酸表面组成员成的喜强酸性状体的恶特质是具有挑战特质的。

ACC的5年总体生存率一般低于40%,但异质特质。结节得病自上而下对指导治疗决策很重要,特别是在来进行治疗。外科上采用的;大要结节得病环境因素是依此Ki-67游离指数。其他结节得病环境因素不一定最;大要尿酸表皮和年长。

以前的遗传组成员科学研究说明了,遗传组成员变动大部分在有所不同的原子亚型。特异特质组成员著者是原子定义的基石。特异特质组成员著者将人体内皮质腺瘤与肝癌区分开来,并确认显现出两台成员与结节得病相关联的ACC:“C1a”亚组成员,其游离遗传过分表述,结节得病缺失;“C1B”亚组成员,具有免疫细胞外观上,结节得病较佳。从特异特质组成员外观上,已推断显现出特定的mRNA标识,如BUB1BPINK1的不同遗传表述。这些靶向标识物改善了ACC的诊疗和结节得病分析报告。然而,到目前为止,特异特质组成员著者及其靶向替代标识物之外高质量的RNA,所需高质量的冰组成员织结果说明了。在正因如此实践里面,换取这种类型的工艺要求较低,而对于ACC患儿来说,往往无法实现。

最近的3’RNA人类遗传组计划新技术逃逸并人类遗传组计划了多腺苷化RNA 3’端的微电影段,这些片段不太非常容易被RNA裂解。与遗传表述微阵列或标准的交界处RNA人类遗传组计划有所不同,这种新技术只所需少量和低质量的RNA,与活体固定碳化包埋(FFPE)结果说明了兼容。

旨在:;大要旨在是利用新的3’端RNA人类遗传组计划新技术,确定活体固定碳化包埋(FFPE)结果说明了的特异特质组成员著者。第二个旨在是通过重点科学研究常见的喜酸细胞会ACT值得注意,示范这种新技术聚焦大型FFPE资料的能力。

新方法:我们划定131实有ACT:来自科钦医院的锻炼描述符和来自杜塞尔多夫医院的独立的测试描述符。用QuantSeq(Lexogen)和NextSeq500(Illumina)从FFPE结果说明了里面造成了3’特异特质组成员。

结果:在锻炼描述符里面,无委派聚类辨认显现出3组成员:“C1A”型摧残特质肝癌(N=28,29%)、“C1B”型肝癌(N=28,29%)和“C2”型腺瘤(N=39,41%)。FFPE特异特质组成员的结节得病效用在的测试描述符里面得到证实(5年OS:C1a组成员为26%(N=26),C1B组成员为100%(N=10),p=0.003)。在最;大要依此和Ki-67的多数组模型里面,FFPE特异特质组成员是一个独立的结节得病环境因素(OS-HR 7.5,p=0.01)。喜强酸炎症会ACT(N=19)未形成任何特异簇。喜酸细胞会肝癌(N=6)和恶特质创造力未明的喜强酸细胞会肝癌(N=4)均为“C1B”。

由此可知1.锻炼描述符里面ACT的FFPE特异特质组成员定义A.基于2000个最易变的遗传对ACT的非委派定义确定了三个;大要组成员,对应于“C1A”摧残特质肝癌、“C1B”惰特质肝癌和“C2”腺瘤。B.可用转化非委派定义的3个非负乘法裂解(NMF)品位的热由此可知。激素(人体内发挥作用)、游离和免疫细胞征象在每种ACT里面的表述。D.三组成员特异特质组成员里面不同最显著的前50个遗传的表述明人。即通过迭代聚类新方法暗示结果说明了密切关系的相似度的一致特质乘法。行和列是患儿结果说明了。一致意见乘法值的以内从0(从不闲聊)到1(始终闲聊)。

由此可知2.有所不同区域内的FFPE特异特质组成员定义。对锻炼描述符里面5名患儿的两个有所不同区域内进行查干精/伊红/锦标弗兰颜料(放大40倍),其里面一个为摧残特质(-a)区,一个为非摧残特质(-b)区。黑条代表50微米。红色上标暗示单倍体。白色上标暗示不值得注意的单倍体。B.描述为5名患儿采样的两个有所不同的区域内,其里面一个是摧残特质(-a),另一个是摧残特质(-b)。不受限制:Fuhrman核级不适可用喜强酸细胞会。C.基于PCA的两个;大成分(Dim1、Dim2)的结果说明了投影基于锻炼描述符的95个鲜明患儿里面的2000个最非对称遗传。来自锻炼描述符的结果说明了说明了为特异特质组成员全校学生著色的模糊圆圈。来自两个有所不同区域内的8名患儿的结果说明了按患儿的橙色说明了为全三角形。

由此可知3.ACC的测试描述符里面的FFPE特异特质组成员定义和结节得病A.结果说明了投影基于PCA的两个;大成分(Dim1,Dim2),基于锻炼描述符里面95个鲜明患儿里面最非对称的2000个遗传。来自锻炼描述符的结果说明了说明了为特异特质组成员全校学生著色的模糊圆圈。来自的测试描述符的结果说明了以特异特质组成员大类著色的完整三角形暗示。B.根据的测试描述符里面I-III期ACC患儿的得出特异特质组成员类型进行无得病生存。根据的测试描述符的I-IV期ACC患儿的得出特异特质组成员定义,总的死亡率。

结论:3’RNA人类遗传组计划法大概FFPE结果说明了里面确定ACT原子类型的一种简便新方法。这项新技术应该有效地正因如此采用和大型回顾科学研究。

原文显现典故:Jouinot A, Lippert J, Sibony M,et al.Transcriptome in paraffin samples for the diagnosis and prognosis of adrenocortical carcinoma.Eur J Endocrinol 2022 Mar 01

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